Målet var medalj och det svenska laget var nära att lyckas men slutade på fjärde plats. Storbritannien vann före Frankrike och Tyskland.
Bästa svenska ryttare blev Magnus Gällerdal på fjortonde plats före Linda Algotsson på femtonde.
Viktoria Carlerbäck gjorde en strålande runda i banhoppningen och var den enda svenska ryttaren som var felfri, totalt slutade hon på tjugotredje plats.
- Det finns alltid saker att jobba vidare på och förbättra men det här visar att vi ökat bredden på de bästa ryttarna, säger Jan Jönsson.
Samtliga sex svenska ryttare som deltog i helgens EM är genom sina resultat kvalade till VM som går nästa år i tyska Aachen.
Zara Phillips var felfri i banhoppningen och hon blev därmed dubbel guldmedaljör.
- Det här överträffar allt jag drömt om, säger Zara som passade på att tacka publiken för deras fantastiska stöd under hela tävlingen.
William Fox-Pitt var felfri på hinder men fick tidsfel, vilket ändå räckte till silver.
Pippa Funnell som låg tvåa inför söndagen fick ett par nedslag och slutade på nionde plats. Ingrid Klimke från Tyskland som låg på sextonde plats efter dressyren och sexa inför banhoppningen gjorde en mycket fin runda och tog brons. Också Piia Pantsu var felfri och avancerade till sjätte plats.
EM lag, slutställning efter dressyr, terrängprov och banhoppning: 1) Storbritannien 136,5 straffpoäng 2) Frankrike 170,2 3) Tyskland 181,9 4) Sverige 192,9 5) Italien 201,7 6) Belgien 205,0
EM individuellt, slutställning efter dressyr, terrängprov och banhoppning: 1) Zara Phillips, Storbritannien, Toytown 38,0 straffpoäng 2) William Fox-Pitt, Storbritannien, Tamarillo 44,3 3) Ingrid Klimke, Tyskland, Sleep Late 45,2 4) Karin Donckers, Belgien, Gormley 46,7 5) Frank Ostholt, Tyskland, Air Jordan 47,4 6) Piia Pantsu, Finland, Ypäjä Karuso 47,8 14) Magnus Gällerdal, Sverige, Keymaster 60,9 15) Linda Algotsson, Sverige, My Fair Lady 63,7 23) Viktoria Carlerbäck, Sverige, Bally's Geronimo 68,3 30) Dag Albert, Sverige, Whos Blitz 72,8 36) Tobias Grönberg, Sverige, Amaretto 80,6 44) Katrin Norling, Sverige, Pandora Emm 92,5